Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR88Q9GZN0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms