Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms