Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM34Q9BYJ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms