Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIFKQ9BYG3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms