Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms