Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms