Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP4Q96PP9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms