Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms