Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TPD52L3Q96J77 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms