Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCMH1Q96GD3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms