Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STAMBPL1Q96FJ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STAMBPL1Q96FJ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms