Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms