Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF428Q96B54 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF428Q96B54 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms