Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 414.67□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 43.4
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 413.54□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 43.4
TBRG4Q969Z0 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 311.99□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 43.4
TBRG4Q969Z0 ARHGEF10L-206ENST00000469726 4585 ntTSL 213.57□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 43.3
TBRG4Q969Z0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.763e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.113e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ARIH1-206ENST00000564062 612 ntTSL 331■■■□□ 2.554e-6■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ARIH1-210ENST00000570085 807 ntTSL 329.09■■■□□ 2.254e-6■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-212ENST00000459777 834 ntTSL 325.67■■□□□ 1.72e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-213ENST00000462924 1018 ntTSL 525.67■■□□□ 1.72e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.652e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 PRKCZ-219ENST00000484419 519 ntTSL 224.76■■□□□ 1.552e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.532e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.522e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.442e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.322e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.242e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.219e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 PARP10-207ENST00000526007 2179 ntTSL 1 (best)22.01■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.052e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.022e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.922e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-214ENST00000466895 948 ntTSL 520.7■□□□□ 0.92e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 LMF1-208ENST00000566609 573 ntTSL 420.05■□□□□ 0.82e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 LMF1-204ENST00000562226 1088 ntTSL 220.05■□□□□ 0.82e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 MAU2-216ENST00000609122 551 ntTSL 419.9■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 43.2
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TBRG4Q969Z0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 43.2
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TBRG4Q969Z0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 43.2
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TBRG4Q969Z0 UXS1-208ENST00000457835 682 ntTSL 418.02■□□□□ 0.482e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-9■■■■■ 43.2
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TBRG4Q969Z0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 NFXL1-205ENST00000507131 2664 ntTSL 215.3■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 43.2
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TBRG4Q969Z0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SNX6-205ENST00000555648 467 ntTSL 315.05■□□□□ -03e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ATG4B-202ENST00000400771 663 ntTSL 515.04■□□□□ -01e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ARFIP1-208ENST00000510831 514 ntTSL 314.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 MCRS1-207ENST00000548602 1666 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 GNL3-203ENST00000460073 583 ntTSL 414.68□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 NR5A1-203ENST00000455734 826 ntTSL 314.58□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 214.49□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SMAD7-202ENST00000545051 2211 ntTSL 214.43□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 43.2
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