Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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TRIM63Q969Q1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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TRIM63Q969Q1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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TRIM63Q969Q1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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TRIM63Q969Q1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TRIM63Q969Q1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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