Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms