Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms