Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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