Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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