Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms