Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms