Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms