Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms