Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms