Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms