Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms