Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms