Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HRCT1Q6UXD1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms