Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms