Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms