Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4L9Q6RFH8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms