Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms