Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms