Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD5Q5TGI4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms