Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms