Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEXMIFQ5QGS0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms