Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD3Q5JSP0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD3Q5JSP0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms