Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms