Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms