Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms