Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms