Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00303Q3SY05 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00303Q3SY05 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms