Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms