Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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