Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms