Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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