Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP6V1FQ16864 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms