Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PDK4Q16654 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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