Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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