Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms